Pada waktu berusia 24 tahun Alex Dirdjo adalah teman satu tarekat dan sesama calon imam Yesuit dengan Anthony de Mello di Poona, India. Tahun 1976, Alex Dirdjo menjadi peserta pertama dari Indonesia yang mengikuti Sadhana, retret ciptaan de Mello yang terkenal di seluruh dunia. Sebagai rohaniwan, Alex Dirdjo telah melayani umat di Pulau Buru, Timor Timur dan Sumba. Setelah 7 tahun menjadi wakil Uskup Agung di Jakarta, dari 1987-1994 ia memimpin Wisma Puruhita, sekolah untuk calon Imam di Jakarta. Mulai 1999 Alex Dirdjo menjabat sebagai Kepala Rumah Tangga Sekolah untuk calon iman Yesuit di Giri Sonta, Jawa Tengah.