F.X. Rahyono lahir di Sala pada tanggal 23 Juni 1956, memperoleh gelar Sarjana Sastra di Jurusan Jawa pada 1987 dan gelar magister humaniora pada 1992 dari Universitas Indonesia setelah mengikuti program sandwich di Leiden, Belanda pada 1989-1992. Pada 1999 ia memulai studi doktornya di bidang ilmu pengetahuan budaya di Program Pascasarjana Universitas Indonesia. Pada bulan April sampai Juni 2001 ia mengikuti kuliah Registration, Analysis and (Re) synthesis of Speech di Laboratorium Fonetik, Leiden, Belanda. Sejak 1989 hingga kini ia menjadi pengajar di Jurusan Daerah, Fakultas Sastra Universitas Indonesia dalam bidang sematik dan pengajaran bahasa. Ia berpengalaman dalam penyusunan buku ajar dan dalam penelitian.